Гайморит возникает в гайморовых пазухах (верхнечелюстных), они самые большие (среди лобных, клиновидных и решетчатых), объем каждой из них примерно около 30 см кубических. Гайморовые пазухи находятся внутри верхней челюсти, при этом их форма (гайморовых пазух) напоминает трехгранную пирамиду.
Внутренняя стенка граничащая с полостью носа имеет отверстие, которое открывается в средний носовой ход носовой полости. При этом дно гайморовых пазух располагается близко от корней верхних зубов, особенно к первому и второму коренному зубу, при этом корни могут заходить в гайморовую пазуху и быть покрыты слизистой оболочкой.